Çağatay Han (Moğolca: Цагадай, Tsagaday, Farsça: چغتاى خان; d. 22 Aralık 1183 – ö. 1 Temmuz 1242), Moğol prensi ve Cengiz Han’ın ikinci oğlu.

Kardeşleriyle birlikte babasının Çin (1211 – 1216) ve Harezm (1219 – 1224) seferlerine katıldı. Harezmşahlar’ın başkenti Urgenç’in ele geçirilmesinde önemli rol oynadı (1221). Moğollar’a yenilerek Hindistan’a kaçan Celaleddin Harezmşah’ı izlemekle görevlendirildi.

Cengiz’in Tangut Seferi sırasında (1225 – 1227) Moğolistan’da bırakılan kuvvetlerin komutanlığına getirildi. Babası ölünce (1227), onun veliaht seçtiği kardeşi Ögedayı büyük han ilan etti. Cengiz Yasası konusundaki uzmanlığı dolayısıyla devlet yönetiminde büyük saygınlık kazandı.

Cengiz tarafından Kara Hıtay’in toprakları verildiyse Maveraünnehir’den Doğu Türkistan’a kadar uzanan bölgede bulunan şehirler İmparatorluğun merkez yönetimine bağlı kalmış ve Ögeday tarafından atanan valilerce yönetilmişti. Kardeşi Ögeday’ın ölümünden (1241) kısa süre sonra öldü. Ölümünden sonra kurulan devlete Çağatay Hanlığı adı verilmişti.